蝸牛の歩み

蝸牛の如く,ゆっくりでも着実に前へ・・・

FirefoxとQuicktime plugin

Windows上でFirefoxを使っているが,動物行動の映像データベースの映像を見ようとすると,一部見られないものがある.さすがにスタッフがこれではまずいので,調査開始.
まず,表示されないのは例えばmomo011122pt05a.ファイルはmpeg1である.このページを開くと,「このページを全て表示するにはプラグインを追加する必要があります」と表示され,映像の表示されるべき部分に「ここをクリックするとプラグインをダウンロードします」と表示される.「プラグインを追加」というボタンをクリックすると「以下のプラグインが利用できます Apple Quicktime 6.5.1」と出るので「追加」ボタンをクリックする.しかし,「プラグインのインストールを完了しました Apple Quicktime 6.5.1 利用できません」と失敗する.そもそもQuicktimeのバージョンは現在6.5.2で,すでに最新バージョンをインストールしているはずなのに,6.5.1をインストールさせようとするのは何かおかしい.
ググると,もじら組フォーラムが引っかかった.

MPEG(*.mpg, *.mpeg)に関連づけられたプラグインがありませんね。
QuickTime ならコントロールパネルの QuickTime -> ブラウザ・プラグイン -> MIME 設定とたどって MPEG にチェックが入っているかを確認してください。

まさにこの通りだった.デフォルトのインストールでこうなるのか,mpegWMPで再生させたいから外したのかは失念.

解析(MrBayes)

今日大学へ来てみると解析が終わっていた.データはOTUが127,塩基が752で,世代数は200万世代やって,AthlonXP 1800+で49.6時間かかった.しかし最後の最後にエラーが……

Setting plot filename to GTRIG.p
Plotting parameters in file GTRIG.p
Could not open file "GTRIG.p"
Error in command "Plot"
Error in command "Execute"

予備試行時はplotできたのに,と思ったら,"plot GTRIG.run1.p"および"plot GTRIG.run2.p"としなければいけないようだ(nruns=2だとpファイルの名前が違う).また,マニュアルを読むとplotは載っていなくて,代わりにsumpコマンドを使うべしということのようだ.sumpだとpファイルの名前を指定しなくてもよく,"sump burin=2000"などと実行すればよい.
次にtreeはできているっぽいのでsumtで合意樹を作成しようとするも

Problem reallocating numFoundInRunOfPart (42400)
Error in command "Tree"
Error in command "Sumt"

となる.この49.6時間がパーかぁ,と思ったのだが,もう一度sumtを実行したらエラー無く実行できた.何だったのだ?
さてtreeファイルができたのだが,Windowsだと何で見たらいいのだろう.TreeViewTreeViewXも文字が重なったりして美しくないし,Mesquiteは操作系がよくわからない.MNKさんのページを参考に何とか系統樹の表示まではこぎつけたものの行き詰まる(枝長を反映させるにはどうするんだろう).PAPU*に持っていくしかないか.

サークルの日誌

id:xnissy:20050604#p1の続き.現役執行部から「OBOGあてのメールを書いたから見てくれ」といってメールが送られてきた.やはり日誌に対する思いに温度差があるのがわかる.現役生は「場所がないから捨てたいんだけど,もし欲しい人がいればあげるよ」くらいにしか思ってない.ところが一部のOBOGにとっては日誌というのは非常に思い入れのあるものらしく,こんなメールを送ろうものなら「俺が引き取るのはあんたらにとっては捨てるのと同じか!?」と怒り出すのは目に見えている.というわけで要revise.渾身のリプライを書いたので疲れた.
某考える会の作業,MOMOの作業もあったりしてゼミ準備がさっぱり進まない……