蝸牛の歩み

蝸牛の如く,ゆっくりでも着実に前へ・・・

解析

Modeltest3.7でモデル選択やりなおし.結局TVM+I+Gで変化無し,と.BICは勝手には計算してくれないのねー.Argumentのとこに「-b -nサンプルサイズ」を指定.このサンプルサイズについて,ドキュメントによると--

One could use the number of characters or the number of characters times the number of taxa as sample size, but none of these options is correct most of the time. Which value to use is up to the user.

えっと,どういうこと?「正しくないけど,キャラクター数でもキャラクター数×OTUでも適当に入れてね」ってこと?
結果はHKY+I+G.hLRT・AICの結果とちゃうやん.悩ましー.ドキュメントには「BICの方がシンプルなモデルを選ぶ傾向がある」とか書いてある.明日ドキュメントをちゃんと読も.