ゼミ準備

失速中．集中力がない．昨日の晩，「何だか頭が熱いなぁ．熱っぽいというのとは違うし．CPUと一緒で頭を使いすぎるとオーバーヒートするんかいな」と言っていたのだが，帰宅して体温を計ると36.9度．今朝起きても36.9度．微熱があるようなないような．今熱を出したらゼミ逃れの言い訳と思われかねないので，これ以上ひどくなりませんように……

• Ratchetの論文(Nixon, 1999)を引用している論文を見てみたけど，Wincladaは分子系統ではほとんど使われてない．形態の解析には使われてるけど．Ratchet法自体はPAUPRatでやってる人ならいる．
• TNTは80 US dollars ですか．うむむ．
• 一日中mantel testの準備．採集地点の経度・緯度を調べるわけだが，114地点もあると大変．あとcollupseしたNEXUSファイルを元に戻したり．これはPerlでスクリプトを組んであったのでさくっと終わるはずが，バグっててチェックに手間取った．結局スクリプトのバグじゃなくて，単にデータの不整合だった（２つのファイルでサンプル名が一致してない，同じサンプル名が２回出てくる，など）．これだけ手間がかかる割には，出てくる結果はmantelのrという値だけだから悲しい．
• 258×258のマトリクスを扱いたいんですが，Excelでは256列しか扱えないという罠．単にcsvファイルから１列目を削除したいだけなので，perl -i.bak -pe 's/^.*?,//' inputfile でオッケー？